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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
14/07/2017 |
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Data da última atualização: |
03/01/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SANTOS, V. S.; MARTINS FILHO, S.; RESENDE, M. D. V. de; AZEVEDO, C. F.; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, S. E. F.; SILVA, F. F. |
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Afiliação: |
V. S. SANTOS, Departamento de Estatística, Universidade Federal de Viçosa; S. MARTINS FILHO, Departamento de Estatística, Universidade Federal de Viçosa; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; C. F. AZEVEDO, Departamento de Estatística, Universidade Federal de Viçosa; P. S. LOPES, Departamento de Zootecnia, Universidade Federal de Viçosa; S. E. F. GUIMARÃES, Departamento de Zootecnia, Universidade Federal de Viçosa; F. F. SILVA, Departamento de Zootecnia, Universidade Federal de Viçosa. |
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Título: |
Genomic prediction for additive and dominance effects of censored traits in pigs. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, v. 15, n. 4, gmr15048764, Oct. 2016. |
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DOI: |
http://dx.doi.org/10.4238/gmr15048764 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Age at the time of slaughter is a commonly used trait in animal breeding programs. Since studying this trait involves incomplete observations (censoring), analysis can be performed using survival models or modified linear models, for example, by sampling censored data from truncated normal distributions. For genomic selection, the greatest genetic gains can be achieved by including non-additive genetic effects like dominance. Thus, censored traits with effects on both survival models have not yet been studied under a genomic selection approach. We aimed to predict genomic values using the Cox model with dominance effects and compare these results with the linear model with and without censoring. Linear models were fitted via the maximum likelihood method. For censored data, sampling through the truncated normal distribution was used, and the model was called the truncated normal linear via Gibbs sampling (TNL). We used an F2 pig population; the response variable was time (days) from birth to slaughter. Data were previously adjusted for fixed effects of sex and contemporary group. The model predictive ability was calculated based on correlation of predicted genomic values with adjusted phenotypic values. The results showed that both with and without censoring, there was high agreement between Cox and linear models in selection of individuals and markers. Despite including the dominance effect, there was no increase in predictive ability. This study showed, for the first time, the possibility of performing genomic prediction of traits with censored records while using the Cox survival model with additive and dominance effects. MenosAge at the time of slaughter is a commonly used trait in animal breeding programs. Since studying this trait involves incomplete observations (censoring), analysis can be performed using survival models or modified linear models, for example, by sampling censored data from truncated normal distributions. For genomic selection, the greatest genetic gains can be achieved by including non-additive genetic effects like dominance. Thus, censored traits with effects on both survival models have not yet been studied under a genomic selection approach. We aimed to predict genomic values using the Cox model with dominance effects and compare these results with the linear model with and without censoring. Linear models were fitted via the maximum likelihood method. For censored data, sampling through the truncated normal distribution was used, and the model was called the truncated normal linear via Gibbs sampling (TNL). We used an F2 pig population; the response variable was time (days) from birth to slaughter. Data were previously adjusted for fixed effects of sex and contemporary group. The model predictive ability was calculated based on correlation of predicted genomic values with adjusted phenotypic values. The results showed that both with and without censoring, there was high agreement between Cox and linear models in selection of individuals and markers. Despite including the dominance effect, there was no increase in predictive ability. This study showed, for the first time,... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Censored data; GBLUP; Mixed model; Modelo mixto; Survival models. |
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Thesagro: |
Porco; Suíno. |
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Thesaurus Nal: |
Animal breeding; Swine. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/161816/1/2016-M.Deon-GMR-Genomic.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
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Data corrente: |
12/03/2020 |
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Data da última atualização: |
18/04/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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Autoria: |
MIRANDA, B. M.; SILVA, A. R.; FALESI, I. C.; SCHWARTZ, G. |
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Afiliação: |
BÁRBARA MAIA MIRANDA, UEPA; ARYSTIDES RESENDE SILVA, CPATU; ÍTALO CLÁUDIO FALESI; GUSTAVO SCHWARTZ, CPATU. |
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Título: |
Classificação e caracterização de solos em três diferentes tipos de manejo no Nordeste paraense. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
In: RIBEIRO, J. C.; SANTOS, C. A. dos (Org.). Competência técnica e responsabilidade social e ambiental nas ciências agrárias. Ponta Grossa, PR: Atena Editora, 2020. |
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Páginas: |
Cap.1, p. 1-10. |
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ISBN: |
978-85-7247-942-4 |
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DOI: |
10.22533/at.ed.424202201 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O estudo pedológico dos solos nos últimos tempos tem apontado à influência de outros fatores de formação no desenvolvimento das propriedades e características dos solos. Diante do exposto, objetivou-se com esse trabalho classificar e caracterizar solos em três sistemas de manejo como o plantio de espécies florestais, floresta secundária e floresta secundária enriquecida com espécies florestais potenciais no Nordeste Paraense, com base nos atributos físico-químicos e na morfologia, afim de ampliar e contribuir para o conhecimento. Assim, foram estudados diferentes perfis dos sistemas de manejo: P1 - Área do Plantio onde foi realizada o plantio de 8 espécies florestais, entre nativas e exóticas, P2 - Área Controle composta por uma capoeira de floresta secundária e P3 - Área Manejo composta por uma capoeira de floresta secundária onde foi realizada abertura de clareiras e enriquecimento com espécies potenciais. Os perfis foram caracterizados morfologicamente e os horizontes foram analisados quanto as características químicas e físicas. Os solos descritos expressaram domínio da estrutura variando de areia a franco-argilo arenosa com a profundidade dos horizontes. O pH em H2O foi aproximadamente entre 4,2 e 5,0. Os valores expressos de CTC foi de 2,3 cmolc kg-1 no P2 a 5,0 cmolc kg-1 no P3, com predomínio de íons de hidrogênio e alumínio, sendo considerados cátions tóxicos. Quanto às características químicas, os solos foram constatados como distróficos com baixa saturação de base. Por meio do estudo, verificou-se discreta a influência dos sistemas de manejo na formação dos solos analisados. MenosO estudo pedológico dos solos nos últimos tempos tem apontado à influência de outros fatores de formação no desenvolvimento das propriedades e características dos solos. Diante do exposto, objetivou-se com esse trabalho classificar e caracterizar solos em três sistemas de manejo como o plantio de espécies florestais, floresta secundária e floresta secundária enriquecida com espécies florestais potenciais no Nordeste Paraense, com base nos atributos físico-químicos e na morfologia, afim de ampliar e contribuir para o conhecimento. Assim, foram estudados diferentes perfis dos sistemas de manejo: P1 - Área do Plantio onde foi realizada o plantio de 8 espécies florestais, entre nativas e exóticas, P2 - Área Controle composta por uma capoeira de floresta secundária e P3 - Área Manejo composta por uma capoeira de floresta secundária onde foi realizada abertura de clareiras e enriquecimento com espécies potenciais. Os perfis foram caracterizados morfologicamente e os horizontes foram analisados quanto as características químicas e físicas. Os solos descritos expressaram domínio da estrutura variando de areia a franco-argilo arenosa com a profundidade dos horizontes. O pH em H2O foi aproximadamente entre 4,2 e 5,0. Os valores expressos de CTC foi de 2,3 cmolc kg-1 no P2 a 5,0 cmolc kg-1 no P3, com predomínio de íons de hidrogênio e alumínio, sendo considerados cátions tóxicos. Quanto às características químicas, os solos foram constatados como distróficos com baixa saturação de base... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Atributos físicoquímicos; Solos paraenses. |
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Thesagro: |
Floresta Secundaria; Granulometria; Pedologia. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/211848/1/document-6.2.pdf
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Marc: |
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260 $c2020
300 $aCap.1, p. 1-10.
520 $aO estudo pedológico dos solos nos últimos tempos tem apontado à influência de outros fatores de formação no desenvolvimento das propriedades e características dos solos. Diante do exposto, objetivou-se com esse trabalho classificar e caracterizar solos em três sistemas de manejo como o plantio de espécies florestais, floresta secundária e floresta secundária enriquecida com espécies florestais potenciais no Nordeste Paraense, com base nos atributos físico-químicos e na morfologia, afim de ampliar e contribuir para o conhecimento. Assim, foram estudados diferentes perfis dos sistemas de manejo: P1 - Área do Plantio onde foi realizada o plantio de 8 espécies florestais, entre nativas e exóticas, P2 - Área Controle composta por uma capoeira de floresta secundária e P3 - Área Manejo composta por uma capoeira de floresta secundária onde foi realizada abertura de clareiras e enriquecimento com espécies potenciais. Os perfis foram caracterizados morfologicamente e os horizontes foram analisados quanto as características químicas e físicas. Os solos descritos expressaram domínio da estrutura variando de areia a franco-argilo arenosa com a profundidade dos horizontes. O pH em H2O foi aproximadamente entre 4,2 e 5,0. Os valores expressos de CTC foi de 2,3 cmolc kg-1 no P2 a 5,0 cmolc kg-1 no P3, com predomínio de íons de hidrogênio e alumínio, sendo considerados cátions tóxicos. Quanto às características químicas, os solos foram constatados como distróficos com baixa saturação de base. Por meio do estudo, verificou-se discreta a influência dos sistemas de manejo na formação dos solos analisados.
650 $aFloresta Secundaria
650 $aGranulometria
650 $aPedologia
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653 $aSolos paraenses
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700 1 $aFALESI, I. C.
700 1 $aSCHWARTZ, G.
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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